除通过遗传毒性/DNA反应性终点试验（如细菌回复突变试验）测试外，还可采用（定量）构效关系预测方法学进行预测。
在采用（定量）构效关系预测方法学进行预测时，应至少采用两种互补的国际公认的预测方法，一种方法应基于专家知识规则，另一种方法应基于统计学，这些预测方法均应遵循经济合作与发展组织（OECD）制定的一般验证原则，可根据具体需要选择合适的方法组合。
可公开获取基于专家知识规则的预测方法有：QSAR Toolbox（OECD）、Toxtree （欧盟联合研究中心JRC）、OncoLogic™（美国环境保护署EPA和OECD）等。可公开获取基于统计学的预测方法有： The US-EPA’sToxicity Estimation Software Tool (T.E.S.T.，EPA)、Lazar（德国联邦风险评估研究所BfR）等。有些预测方法可能包含多个子模型，如VEGA（意大利科学健康研究所IRCCS）致突变模型。此外，还有一些商业模型的预测方法也可以选择使用。
