温州市生态环境局‌是负责温州市生态环境保护和管理的政府机构，其主要职责包括建立健全生态环境有关制度‌、重大生态环境问题的统筹协调和监督管理‌、污染物排放总量控制计划的落实‌、环境污染防治的监督管理‌，监督管理饮用水水源地生态环境保护工作，组织指导城乡生态环境综合整治工作，监督指导农业面源污染治理工作。