办理新化学物质环境管理常规登记证变更或简易登记证变更，收到补正一次性告知书的需要在系统里重新填报一份新的吗？

不需要。请按照补正要求在原申请表上进行修改提交，不需要重新进行填报，具体操作如下：在新化学物质网上登记系统中点击表单所属的申请事项，进入后点击上方的“历史记录”查找表单对应的SN号，点击“补正”进行编辑、提交。